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表观水平
RRBS测序

RRBS 由于经过了Bisulfite 处理,凭借着其单碱基分辨率,能够精确评估覆盖区域的甲基化水平。再加上酶切打断的原理,该方法的覆盖范围具有良好的重复性和稳定性,并且能通过酶切位点 过滤部分降解片段对结果的影响。但是RRBS 的覆盖范围被酶切位点所限制,只能覆盖基因组的部分区域,主要集中在promoter 和CpG island 等富含CpG 的区域。在疾病研究中,Promoter 的甲基化状态与基因表达、性状表型息息相关,RRBS 作为一种关注CpG-rich 区域的甲基化研究方法,能够避免过多的数据浪费,更有针对性的研究覆盖区域的甲基化状态



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RRBS测序

        RRBS 由于经过了Bisulfite 处理,凭借着其单碱基分辨率,能够精确评估覆盖区域的甲基化水平。再加上酶切打断的原理,该方法的覆盖范围具有良好的重复性和稳定性,并且能通过酶切位点 过滤部分降解片段对结果的影响。但是RRBS 的覆盖范围被酶切位点所限制,只能覆盖基因组的部分区域,主要集中在promoter 和CpG island 等富含CpG 的区域。在疾病研究中,Promoter 的甲基化状态与基因表达、性状表型息息相关,RRBS 作为一种关注CpG-rich 区域的甲基化研究方法,能够避免过多的数据浪费,更有针对性的研究覆盖区域的甲基化状态,使得大样本量单碱基分辨率的甲基化差异研究成为可能。综上所 述:RRBS 作为一种高性价比的甲基化研究方法,在大规模的临床样本的研究中具有广泛的应用前景。


应用领域

大样本单碱基分辨率甲基化差异分析

疾病分子标记开发



技术路线

RRBS.jpg

 

分析内容

1. 标准信息分析

   a)去接头污染,去低质量reads 和产量情况统计

   b)RRBS 序列与参考序列的比对(基于a)

   c)Promoter 和CpG 岛(CGI)覆盖度分析(基于a,b)

   d)Promoter 和CGI 区的甲基化分析(基于a,b)

   e)差异性甲基化区域(DMR)分析(基于a,b)

2. 高级信息分析

结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容


样品要求

样品类型:DNA 样品;

样品需求量:总量≥ 3μg,浓度≥50ng/μL;

样品完整性:DNA 无明显降解与蛋白污染,需提供凝胶电泳检测胶图