当前位置:首页 > 产品与服务 >表观水平

表观水平
全基因组甲基化测序

Bisulfite(全基因组甲基化测序):利用Bisulfite(亚硫酸盐)对基因组进行处理后上机测序。应用领域:测序可精确到单个碱基的甲基化, 能得到全基因组的甲基化位点信息,可用于全基因组DNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;基因调控分析;疾病的甲基化标志物等。



服务电话:020-29842086 QQ:3035704779 
邮箱:service@biotask.cn

全基因组甲基化测序

全基因组甲基化测序

        Bisulfite(全基因组甲基化测序):利用Bisulfite(亚硫酸盐)对基因组进行处理后上机测序。应用领域:测序可精确到单个碱基的甲基化, 能得到全基因组的甲基化位点信息,可用于全基因组DNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;基因调控分析;疾病的甲基化标志物等。


应用领域

全基因组DNA甲基化图谱构建

基因调控分析



技术路线

全基因组甲基化.jpg

 

分析内容

1. 标准信息分析

  a)   对测序数据进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估;

  b)   去接头污染,去低质量reads和产量情况统计

  c)   Bisulfite 测序序列与参考基因组序列的比对

  d)   深度和覆盖度分析

  e)   C 碱基的甲基化水平

  f)   全基因组甲基化水平分布趋势

  g)  全基因组DNA甲基化图谱

  h)  差异性甲基化区域(DMR)分析

 2. 高级信息分析

根据具体研究进行的细节分析


样品要求

样品类型:DNA 样品;

样品需求量:总量≥5μg,浓度≥50ng/μL;

样品完整性:DNA 无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。

项目周期

单个样品标准流程(上图)的运转周期约为60个工作日,遇样品数较多时,项目周期根据项目规模而定。